Klubi registreeris Eesti Meistrivõistlustele 5 võistkonda

1.veebruaril lõppes registreerimine selle hooaja Eesti meeste ja noorte meistrivõistlusteks.
Jalgpalliklubi FC Kotkas registreeris ühe meeste ning 4 noorte võistkonda. Võistkonnad kannavad nime JK Kotkad

JK Kotkad võistkonnad ja neid juhendavad treenerid:
meeste III liiga, treener Märt Kosemets (mehed ja noored 1990-92.a)
vanuseklass B2 I liiga, treener Heigo Väljas (1994.a)
vanuseklass D1, treener Enn Läänmäe (1997-98.a)
vanuseklass E1, treener Heigo Väljas (1999-2000.a)
vanuseklass E2, treener Mart Raukas (2000-2001.a)

Lisaks osalevad klubi A- ja B-klassi noored taas Eliitliigades.

1991-92 noored mängivad U19 Eliitliigas FC Flora süsteemi kuuluvas võistkonnas, mis on täna veel täpsustamisel.

1994 noored mängivad koos FC Flora noortega U17 Eliitliigas Valga Warriori nime all, kus treeneriteks on Heigo Väljas (JK Kotkas) ning Ilmar Põhjala (FC Flora).